五源学说有点类似于中医的五行学说，但又独具特色:藏医的五源学说中的“五源”主要指水、土、火、气(风)、空这5个万物生机之源〔。。《四部医典》记载“万物之生机来源于五源(即水、土、火、风、空)，药物的生长亦来于五源。即水为药物生长之汁液;土为药物生长之本源;火为药物生长之热源;气(风)为药物生长之动力;空为药物生长之空间。五源缺一，特别是空缺了，药物则无生机。”这一精辟论述，阐明了药物生长与自然环境的辩证关系，揭示了生态环境对植物生长的特殊性，也为构筑藏药的八性、六味、和十七功效提供了理论依据。
藏药的这一论断与中药药性的形成理论有异曲同工之妙:中药药性的形成，以阴阳五行理论为指导，亦受地理自然生态环境的影响，四气(也称四性)、五味形成之理与藏药相类似。中医药理论认为，天为阳，气生于天，具有升发之性，故亦为阳，随着节气变化，药物形成寒凉温热之性;地为阴，味源于地，故亦为阴，随地气五行及方位的变化，药物也有了酸苦甘辛咸之别。可以说，藏医药的五源学说与中医的阴阳五行理论存在某种联系，也从侧面反映了藏医药理论在某种程度上吸收了部分中医药理论的精华，并结合藏民族独有的医药文化特色，逐步形成了系统而独特的理论体系。
基于此，藏药的药性理论可以定义为:藏药药性理论是以五源学说为基础，以三因学说为指导，主要研究藏药的性质、功效及其运用规律的理论，其核心主要包括六味、八性、十七功效等。这就是基于五源学说的藏药药性理论。
五源学说与药性特征、病种之间的关系
藏医认为万物之生机来源于五源，药物的生长亦来源于五源，从而使得五源之“土、水、火、风、空”各自衍生出了不同的药性特征，不同的药性特征又对应治疗不同的病种，这些并种主要按照三因学说进行划分，主要包括“龙病、赤巴、培根”三大类。具体的对应关系见表1。从表中可知，土性强的药物具有重、稳、柔、钝、润、干之效，可强筋骨，治“龙”病;水性强的药物具有稀、寒、重、钝、润、软、温、柔之效，可使七大物质基础聚集，亦治“赤巴”病。火性强的药物具有热、锐、燥、轻、润、动之效，可生热促使七大物质基础的成熟，能治“培根”病。十七效亦源于药物的药味，如药味味甘、苦、涩者属于寒性效能;威、涩、甘者属于钝性效能酸、苦、辛者属于轻和糙的效能;辛、酸、咸者属于热和锐的效能。药物的药味和“三化味”相同，在临床上疗效理想。
五源学说与药味(六味)之间的关系
前面提到了藏医药的五源学说中的“五源”，主要指“水、土、火、气(风)、空”这5个万物生机之源。藏药的六味则指药物在人味蕾中的感觉，即包括:酸、苦、甘、辛、咸、涩这六味。药物的六味可以用五源学说中的水、土、火、气(风)、空这5个要素之间的相关作用和关系进行解释:土与水偏胜，则药甘;土与火偏胜，则药酸;水与火偏胜，则药咸;水与风偏胜，则药苦;火与风偏胜，则药涩叨。因此，这就是药物六味的五源学说衍生理论，五源相互作用及与药物六味的衍生关系。
藏药的药味学说除了多了一味“涩”味以外，与中药的“五味”(酸、苦、甘、辛、咸)颇有类似之处，但需指明的是，中药的五味不只是药物通过人的感觉器官辨别出来的，表征药物在味蕾中真实味道的反映，更重要的是不同药味的药作用于机体后，产生了不同的效应，获得了不同的治疗效果，在此基础上总结归纳出了中药“五味”理论，可以说中药五味超出了味觉的范围，是建立在功效基础上的对机体的综合效应，这与藏药的“六味”又有一定程度上的不同。
