藏医的治疗系统中，还有一种饮食疗法，受到高度的重视。可能是受到唐代汉族中医传入藏区的医学思想的影响，藏医也曾提出；人患病时，最好首先用调理饮食的方法，进行治疗，并注意起居养生。当饮食疗法失败后，才去寻求其他疗法。
藏医对饮食与身体健康及疾病的关系，非常重视，并且有较明确的规定。传统的观念认为食物大致可分为谷物、油脂、肉类、绿叶蔬菜和液态食物这几类。
谷物指稻米、小米、荞麦、青稞等等，这类食物可增加人体的精液，因为谷物都是甘味的，也易于消化。如大米属轻性，可使体内隆、赤巴和培根减少，而使精液增多，可治疗身体的肌肉松弛。骨折时应吃小米，但小米可使体内的炎症加剧。
豆类的本性轻而甘、凉，治腹泄，可增加体内的血、赤巴和脂肪。除食用以外，还可用豆粉搽身。芝麻性寒，可增加体内精液，治疗隆病。
油脂类性凉、重、味甘，对身体有补养作用，体弱、妇女及老年人更需要。酥油本性凉，使人气色好，精力充沛，但陈酥油使人健忘，体力衰微。藏医重视油脂类食物，与民族习惯及高寒地势的自然条件有关。
肉类也是藏族常用食物，认为其药性凉、轻而粗，但平原上，的动物肉的药性温而重，前者治疗培根发热症，后者对胃痛、背痛均有疗效。死动物的肉有毒，不能食用。
绿叶蔬菜如生长在干燥地区，是温而轻的，但生长在潮湿地区者则药性凉而重。前者可治肾病和风湿病，而后者则可治疗发热性疾病。
在液态食物中，藏族最重视奶类和水的治疗作用。认为牛奶味甘，使人面色红润、皮肤有光泽，药性凉而重，可产生培根。奶牛的奶可治肺结核，对眩晕、咳嗽、口渴、饥饿、尿频等，都有一定疗效。
山羊奶药性轻，可治呼吸困难，腹泻及因发热而出血的疾病。
生奶药性重而凉，刚挤出的奶有如甘露，营养极好，但纯奶并不容易消化。
藏医也非常重视水的医疗作用。认为可供医用的水有雨水、雪水、河水、泉水、井水、海水、森林水。其中雨水的质量最好，因为它在降落的过程中，与日光、月光和风接触过，是有活力的，可以提神，轻似甘露。当然，最好是在开阔地区，用干净的容器收集的，其治疗质量最好。混浊的雨水或掺入杂物，又不见日光、月光的，则不能做医疗用。
凉水可以治疗酒精中毒、昏迷、恶心、头晕。沸水凉后药性轻，对赤巴病人有益。
藏医认为，酒精可助消化，有助于消化之火，其药性甘、酸、辛，可治失眠，也可治多眠症。适量饮酒，对瘦削的人有益健康；老酒对隆病、培根病有益。但饮用过多，则等于是饮毒药。
藏医对老年人的营养尤其重视，认为应该常用补养法，其方由寒水石、茅羔菜、黄精、天冬、手掌参等组成，研末后，加入蜂蜜、红糖、酥油，制成丸药，长年服用。
藏医还很强调依据季节来调整起居饮食，适应环境，以达到养生长寿的目的。除了按天气的寒热温凉增减衣着，趋暖避寒等一般性常识以外，还要注意及时调理饮食，与季节相适应，才能增强体质，提高抗病能力。
如在冬季，应当食饱，多吃酸、甘、咸味食物，芝麻油可涂搽，肉汤及油腻食物也可适当多吃，至春季，胃火不如冬季炽盛，消化力稍减，应多吃苦、辣、涩三味食品，如陈青稞、干燥地区畜肉、饮用蜂蜜，可用豆类粉面搽涂身体。至夏暑季节，宜吃轻性、甘性及凉性食物，不吃咸、辣、酸等味；及至长夏，也即夏未季节，高原雨季来临，胃火稍衰，反而要食用甘、酸、咸三味，并适当饮用干燥地区植物所酿之酒。及至秋季、食物应以甘、苦、涩味为本。总之，饮食应根据季节进行调整，切忌一成不变，更不要食用与季节相抵触的食物，以免有碍健康。至于各类食物的性和味，早在《四部医典》中就有详细论述。
